MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Liberibacter crescens BT-1 chromosome

Total Repeats: 36544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019907	AAT	2	6	23	28	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805347
2	NC_019907	GAAAA	2	10	36	45	80 %	0 %	20 %	0 %	431805347
3	NC_019907	GTC	2	6	67	72	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805347
4	NC_019907	GCTATT	2	12	81	92	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431805347
5	NC_019907	A	6	6	176	181	100 %	0 %	0 %	0 %	431805347
6	NC_019907	TAT	3	9	220	228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805347
7	NC_019907	TCAT	2	8	242	249	25 %	50 %	0 %	25 %	431805347
8	NC_019907	TGG	2	6	284	289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431805347
9	NC_019907	CTG	2	6	292	297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805347
10	NC_019907	T	6	6	430	435	0 %	100 %	0 %	0 %	431805347
11	NC_019907	CGT	2	6	453	458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805347
12	NC_019907	TGA	2	6	563	568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805347
13	NC_019907	AGA	2	6	569	574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805347
14	NC_019907	GAA	2	6	594	599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805347
15	NC_019907	CTTT	2	8	612	619	0 %	75 %	0 %	25 %	431805347
16	NC_019907	T	7	7	617	623	0 %	100 %	0 %	0 %	431805347
17	NC_019907	AAG	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805347
18	NC_019907	A	6	6	635	640	100 %	0 %	0 %	0 %	431805347
19	NC_019907	ATT	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805347
20	NC_019907	GTTT	2	8	727	734	0 %	75 %	25 %	0 %	431805347
21	NC_019907	TAC	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805347
22	NC_019907	TTAGAT	2	12	804	815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	431805347
23	NC_019907	CAG	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805347
24	NC_019907	AAG	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805347
25	NC_019907	AGA	2	6	894	899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805347
26	NC_019907	TTA	2	6	936	941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805347
27	NC_019907	TTC	2	6	950	955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805347
28	NC_019907	A	6	6	980	985	100 %	0 %	0 %	0 %	431805347
29	NC_019907	TCA	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805347
30	NC_019907	TGA	2	6	1034	1039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805347
31	NC_019907	AATAA	2	10	1095	1104	80 %	20 %	0 %	0 %	431805347
32	NC_019907	A	6	6	1103	1108	100 %	0 %	0 %	0 %	431805347
33	NC_019907	TAT	2	6	1109	1114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805347
34	NC_019907	ATA	2	6	1117	1122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805347
35	NC_019907	A	6	6	1156	1161	100 %	0 %	0 %	0 %	431805347
36	NC_019907	AGC	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805347
37	NC_019907	AAC	2	6	1303	1308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431805347
38	NC_019907	T	6	6	1321	1326	0 %	100 %	0 %	0 %	431805347
39	NC_019907	TAAA	2	8	1343	1350	75 %	25 %	0 %	0 %	431805347
40	NC_019907	ATG	2	6	1366	1371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019907	ATG	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805348
42	NC_019907	CTA	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805348
43	NC_019907	A	6	6	1636	1641	100 %	0 %	0 %	0 %	431805348
44	NC_019907	CAG	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805348
45	NC_019907	TA	3	6	1685	1690	50 %	50 %	0 %	0 %	431805348
46	NC_019907	AAG	2	6	1703	1708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
47	NC_019907	AAG	2	6	1745	1750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
48	NC_019907	CTT	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805348
49	NC_019907	AGA	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
50	NC_019907	AT	3	6	1813	1818	50 %	50 %	0 %	0 %	431805348
51	NC_019907	GTT	2	6	1828	1833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805348
52	NC_019907	GAA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
53	NC_019907	ATA	2	6	1919	1924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805348
54	NC_019907	ATTA	2	8	1935	1942	50 %	50 %	0 %	0 %	431805348
55	NC_019907	A	6	6	1993	1998	100 %	0 %	0 %	0 %	431805348
56	NC_019907	GGCA	2	8	2023	2030	25 %	0 %	50 %	25 %	431805348
57	NC_019907	CTG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805348
58	NC_019907	TAA	2	6	2079	2084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805348
59	NC_019907	AAC	2	6	2112	2117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431805348
60	NC_019907	TAT	2	6	2133	2138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805348
61	NC_019907	AT	3	6	2164	2169	50 %	50 %	0 %	0 %	431805348
62	NC_019907	AGA	2	6	2214	2219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
63	NC_019907	TCA	2	6	2250	2255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805348
64	NC_019907	ATTC	2	8	2343	2350	25 %	50 %	0 %	25 %	431805348
65	NC_019907	ATT	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805348
66	NC_019907	GCA	2	6	2515	2520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805348
67	NC_019907	GAAT	2	8	2537	2544	50 %	25 %	25 %	0 %	431805348
68	NC_019907	TAG	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805348
69	NC_019907	GAT	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805348
70	NC_019907	AG	3	6	2754	2759	50 %	0 %	50 %	0 %	431805348
71	NC_019907	TGAA	2	8	2783	2790	50 %	25 %	25 %	0 %	431805348
72	NC_019907	TAAA	2	8	2792	2799	75 %	25 %	0 %	0 %	431805348
73	NC_019907	CTT	2	6	2843	2848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805348
74	NC_019907	TATCC	2	10	2903	2912	20 %	40 %	0 %	40 %	431805348
75	NC_019907	AAC	2	6	2981	2986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431805348
76	NC_019907	ATC	2	6	2997	3002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805348
77	NC_019907	TA	3	6	3013	3018	50 %	50 %	0 %	0 %	431805348
78	NC_019907	GAA	2	6	3055	3060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
79	NC_019907	ATT	2	6	3086	3091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805348
80	NC_019907	TTAAAA	2	12	3118	3129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805348
81	NC_019907	CTG	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805348
82	NC_019907	CTTTAT	2	12	3194	3205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	431805348
83	NC_019907	A	6	6	3219	3224	100 %	0 %	0 %	0 %	431805348
84	NC_019907	TAT	2	6	3231	3236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805348
85	NC_019907	AGA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805348
86	NC_019907	AAGA	2	8	3329	3336	75 %	0 %	25 %	0 %	431805349
87	NC_019907	ACA	2	6	3339	3344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431805349
88	NC_019907	T	6	6	3351	3356	0 %	100 %	0 %	0 %	431805349
89	NC_019907	CTA	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805349
90	NC_019907	TCT	2	6	3391	3396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805349
91	NC_019907	TTTA	2	8	3449	3456	25 %	75 %	0 %	0 %	431805349
92	NC_019907	GTG	3	9	3491	3499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431805349
93	NC_019907	TAT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805349
94	NC_019907	GATG	2	8	3544	3551	25 %	25 %	50 %	0 %	431805349
95	NC_019907	A	6	6	3577	3582	100 %	0 %	0 %	0 %	431805349
96	NC_019907	T	6	6	3588	3593	0 %	100 %	0 %	0 %	431805349
97	NC_019907	ATA	2	6	3752	3757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805349
98	NC_019907	T	8	8	3768	3775	0 %	100 %	0 %	0 %	431805349
99	NC_019907	TAA	2	6	3804	3809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805349
100	NC_019907	AAT	2	6	3902	3907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805349
101	NC_019907	TAT	2	6	3956	3961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805350
102	NC_019907	AGG	2	6	3980	3985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431805350
103	NC_019907	ACT	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805350
104	NC_019907	AGC	2	6	4028	4033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805350
105	NC_019907	GA	3	6	4039	4044	50 %	0 %	50 %	0 %	431805350
106	NC_019907	TTGATC	2	12	4057	4068	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	431805350
107	NC_019907	GA	3	6	4101	4106	50 %	0 %	50 %	0 %	431805350
108	NC_019907	TCT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805350
109	NC_019907	ATT	2	6	4197	4202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805350
110	NC_019907	T	6	6	4261	4266	0 %	100 %	0 %	0 %	431805350
111	NC_019907	GAA	2	6	4290	4295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805350
112	NC_019907	TTA	2	6	4317	4322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805350
113	NC_019907	TCC	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431805350
114	NC_019907	AGC	2	6	4367	4372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805350
115	NC_019907	T	6	6	4404	4409	0 %	100 %	0 %	0 %	431805350
116	NC_019907	CAA	2	6	4530	4535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431805350
117	NC_019907	GTT	2	6	4536	4541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805350
118	NC_019907	AAT	2	6	4554	4559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805350
119	NC_019907	CTT	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805350
120	NC_019907	TA	3	6	4674	4679	50 %	50 %	0 %	0 %	431805350
121	NC_019907	GCT	2	6	4722	4727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805350
122	NC_019907	GAAA	2	8	4734	4741	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019907	A	8	8	4739	4746	100 %	0 %	0 %	0 %	431805351
124	NC_019907	TGC	2	6	4787	4792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805351
125	NC_019907	ATA	2	6	4822	4827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805351
126	NC_019907	ATC	2	6	4880	4885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805351
127	NC_019907	AAT	2	6	4893	4898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805351
128	NC_019907	GAA	3	9	4917	4925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805351
129	NC_019907	TCAA	2	8	4940	4947	50 %	25 %	0 %	25 %	431805351
130	NC_019907	TCG	2	6	4949	4954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805351
131	NC_019907	GTAC	2	8	4980	4987	25 %	25 %	25 %	25 %	431805351
132	NC_019907	AGA	2	6	4994	4999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805351
133	NC_019907	AAT	2	6	5009	5014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431805351
134	NC_019907	ACG	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805351
135	NC_019907	TGC	2	6	5036	5041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805351
136	NC_019907	TTA	2	6	5071	5076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805351
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138	NC_019907	TTG	2	6	5116	5121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805351
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141	NC_019907	ATT	2	6	5220	5225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431805351
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267	NC_019907	TCT	2	6	9156	9161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805354
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270	NC_019907	T	7	7	9219	9225	0 %	100 %	0 %	0 %	431805354
271	NC_019907	GCT	2	6	9259	9264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805354
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